2. 可视化轨迹并导出动画

2.1. 以XYZ轨迹文件为例查看轨迹并导出动画

本例中使用的文件可以在这里下载：Files.

1. 通过访问与安装，可视化文件或SMILES代码的两种方法（拖拽 / 选择文件）使 .xyz 文件在 Qbics-MolStar 界面显示渲染。

2. 请注意，可查看轨迹的前提是当前您所选取的 .xyz 文件存在多帧信息。

3. 此处，我们开启Dynamic Bonds按钮，以动态观察键连的变化。

4. 点击图形界面左上角Select Animation按钮，选择不同的轨迹或场景动画演示方式。在此处，我们选择系统默认的 Animate Trajectory 方法（分子模拟轨迹）

5. 点击Start按钮，渲染轨迹动画。

5. 动画播放效果如下：

6. 点击Qbics-MolStar界面右下角Export Animation按钮实现轨迹导出功能（此处与Select Animation按钮下的选择情况一致）。

7. 点击Render按钮，使Qbics-Molstar进行轨迹处理。（若提示 Rendering successful 后，您希望更换当前的处理结果，可以点击下方的Clear做清除处理。）

8. 存在 4 种文件类型可以导出：MP4，AVI，GIF，MKV。

9. 确定希望导出的文件类型后，点击Save Animation导出结果。

10. 此处作为示例，为您展示 GIF 的输出结果。

    

2.2. 以GRO + XTC文件为例查看轨迹并导出动画

本例中使用的文件可以在这里下载：Files.

XYZ格式中的轨迹既有坐标也有拓扑信息，但是很多分子动力学使用一些二进制格式的轨迹文件，如XTC（GROMACS 压缩格式），它们中并不包含拓扑信息。在 Qbics-MolStar 中，您可以组合任意包含拓扑信息和坐标信息的文件来读轨迹。这里以GRO+XTC来掩饰。

1. 在 Load Files - Model部分选择 .gro 文件作为体系的初始结构信息（选择文件的操作步骤详见访问与安装，可视化文件或SMILES代码）:

2. 在 Load Files - Coordinates部分选择 .xtc 文件获取模拟过程中的轨迹坐标信息（选择文件的操作步骤详见访问与安装，可视化文件或SMILES代码）:

3. 点击 Apply去命令 Qbics-MolStar 渲染轨迹

4. 渲染结果如下：

5. 重复本篇教程的上一示例中，关于导出动画的操作流程。

6. 此处同样，以 GIF 文件格式作为示例为您展示轨迹动画结果。

   

2.3. 以蛋白质为例导出旋转动画

1. 在此处我们以 3KB0 蛋白质为例。

2. 首先，我们在 PDB Id位置键入 3KB0， 并点击 Apply获取蛋白质文件。

3. 渲染结果如下：

4. 针对蛋白质体系，我们在 Animation选项中选择 :guilabel:`Camera Spin`（旋转相机视角）来进行动画演示

5. 在 Export Animation部分，更改默认 Animate Trajectory 为 Camera Spin。

6. 点击 Render按钮，使 Qbics-Molstar 实现轨迹渲染：

7. 我们在此处同样选取 GIF 格式的动画，并将输出文件作为示例进行展示。